流量稍大的微型氣泵往往噪音不理想。微型氣泵噪音主要由機械振動噪音和氣流噪音兩部分組成。品質好的微型氣泵如果安裝得好，機械振動噪音很小，氣流噪音是噪音的主要的來源。大量的氣體在狹小的泵內高速流動必然產生噪音，對這部分噪音進行處理是非常重要的，但常常被忽視。因此選配消音器是必要的。對消音器不僅要求它的消音效果好，還要它的阻力小，它不能大量衰減流量。因為噪音與整個氣路系統都相關，因此消音器安裝在泵的進氣口還是排氣口、安裝幾只，都需要配合整個系統的情況確定，不是千篇一律的，這需要我們試驗才能得到最佳方案。
消音器上的彎頭和直通接頭都可作為連接泵進、排氣口的連接端，由使用者根據消音效果自行試驗確定。建議在泵的抽氣口和排氣口都連接消音器，消音效果最佳。在條件不允許進、排氣口同時連接時，可根據實際效果自行確定在泵的抽氣口或排氣口連接消音布。
對于一般市面上容易買到的消音器，往往是用在高壓氣動系統上的，阻力很大，不能用于微型氣泵，容易損壞泵。
還有一種降低氣流噪音的簡單方法。就是故意在抽氣口或排氣口端使用較長的管子，并把管子故意盤繞，總之就是要改變氣流狀態，如果改變得合適也可以降低噪音。
如果泵自帶減震腳對于降低機械振動噪音是很好的，否則要自已配減震裝置。
